Фамилия Шалинов образована по самой частотной модели русских фамилий — с суффиксом -ов, который присоединяли к основе, оканчивающейся на согласный. Основа здесь — Шалин. Это не имя и не географическое название, а скорее усеченная форма отчества или прозвища, которое, в свою очередь, пошло от слова «шальной».

Прозвище Шалый или Шальной в старину давали человеку с неспокойным, порывистым, взбалмошным характером. В северных и сибирских говорах слово «шала» могло означать «сорванец», «озорник», а в некоторых диалектах — «бесшабашный гуляка». От этого прозвища сначала возникла фамилия Шалин (чей сын? — Шалин), а затем, при дальнейшем словообразовании, появился Шалинов — то есть потомок Шалина, внук или правнук того самого «шального» предка. Такой двойной суффикс (Шалин + ов) встречается реже, чем простой Шалин, но он фиксирует более позднюю ветвь рода.

Версия о происхождении от тюркского имени Шаля или Шали (уменьшительное от Шах-Али) маловероятна: в этом случае фамилия писалась бы через «а» после «ш» и чаще звучала как Шалеев или Шалиев. Русская огласовка «Шалин» и ударение на второй слог (ШалИнов) указывают именно на внутреннее, славянское происхождение от прилагательного «шалый».

По сословной принадлежности Шалиновы, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Фамилия не встречается среди старых дворянских родов, внесенных в родословные книги. Географически она тяготеет к центральным и поволжским областям России, где слово «шалый» было в ходу, — встречается в архивах Тамбовской, Рязанской, Нижегородской губерний.

Любопытная деталь: фамилия Шалинов может быть «вторичной» — то есть ее получили не от прозвища, а от однофамильцев Шалиных, которые перебрались в другое село и для различия с местными Шалиными добавили суффикс -ов. Такие случаи в русской ономастике описывал Б. Унбегаун, и они не редкость для фамилий на -ин, которые затем «наращивали» второй патронимический суффикс.