Фамилия Шамут — редкий случай, когда версия происхождения неочевидна и требует разбора сразу нескольких языковых пластов. В отличие от большинства русских фамилий на -ов или -ин, здесь нет типичного суффикса принадлежности, а окончание -ут сразу наводит на мысль о нерусском корне.

Скорее всего, фамилия имеет тюркское или арабское происхождение. Основа «шам» в тюркских языках означает «свеча, светильник» (от персидского šam‘). В таком случае Шамут — это прозвище человека, который либо делал свечи, либо был прозван за что-то светлое, заметное. Суффикс -ут в тюркских языках может быть уменьшительным или указывать на профессию (сравните с татарскими фамилиями типа Хайрутдинов, где -ут — часть сложного имени). Таким образом, Шамут могло означать «маленькая свеча» или «светильник» — прозвище, данное по занятию или внешности.

Вторая версия связывает фамилию с арабским корнем «шам», обозначающим Сирию и город Дамаск (Эш-Шам). В таком случае Шамут — это указание на выходца из тех земель: сириец, дамаскинец. Суффикс -ут мог закрепиться в русской среде как адаптация арабского окончания. Эта версия правдоподобна, если учесть, что фамилия встречается у народов Северного Кавказа и в среде крымских татар, где были сильны связи с Османской империей и арабским миром.

Есть и более прозаичное объяснение: фамилия могла возникнуть от мирского имени или прозвища Шамут, которое давали ребенку, родившемуся в субботу (ивритское «шаббат» через тюркское посредство). Но это лишь гипотеза, так как прямой связи с иудейской традицией в русских документах не прослеживается.

В русских метрических книгах фамилия Шамут встречается крайне редко, в основном у татар, башкир и народов Дагестана. Это не дворянская фамилия и не крестьянская в классическом понимании — скорее, она принадлежала ремесленникам, торговцам или выходцам из мусульманских регионов, которые оседали в городах Поволжья и юга России.