Фамилия Шашарин — редкий случай, когда основа и суффикс не складываются в очевидную картину. С первого взгляда напрашивается суффикс -ин, типичный для русских фамилий, образованных от существительных или прилагательных на -а/-я (типа Бородин, Пушкин). Однако корень «шашар» в русском языке не встречается ни в одном из известных значений. Это заставляет искать объяснение за пределами восточнославянской лексики.

Самая вероятная версия — тюркское происхождение основы. В тюркских языках есть слово «шаш» (волосы, кудри) или глагол «шашмак» (торопиться, суетиться). Прозвище Шашар могли дать человеку с необычной прической, кудрявого, либо, наоборот, суетливого и непоседливого. В русской среде такие прозвища нередко адаптировались через добавление суффикса -ин, который указывал на принадлежность: «чей? — Шашарин», то есть сын или потомок Шашара.

Есть и менее очевидный вариант — связь с диалектным словом «шашар» (или «шашур»), которое в некоторых говорах означало нечто вроде «пустомеля», «болтун» или «шаркун» (человек, который шарит, роется в вещах). Но это лишь гипотеза, не подтверждённая словарями. Если опираться на географию, то фамилия Шашарин встречается в регионах, где исторически был силён тюркский субстрат: в Поволжье, на Урале, в Западной Сибири. Это косвенно поддерживает версию о заимствованном прозвище.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в ряду таких же «тёмных» фамилий на -ин, как Шамарин, Шабурин, Шапорин. Их объединяет то, что корень не имеет прозрачной славянской этимологии, а суффикс — стандартный русский. Носитель фамилии Шашарин может с высокой долей вероятности предполагать, что его предок получил прозвище от тюркского слова, а затем это прозвище закрепилось за родом в XVI–XVII веках, когда шла активная миграция служилых людей и крестьян на восток.