Фамилия Шайдоров — редкий пример, где исходное прозвище почти наверняка связано с тюркскими языками, а не с русскими корнями. Основа «шайдор» или «шайдар» в тюркских наречиях имеет несколько значений, и все они сводятся к характеристике человека. Самое вероятное — от слова «шайдар» (или «шайда»), означающего «смелый», «удалой», «лихой». В казахском и башкирском языках «шайдар» — это не просто смелость, а скорее дерзкая, показная удаль, молодечество. Прозвище Шайдор могли дать человеку отчаянному, задиристому, возможно, участнику набегов или просто балагуру-храбрецу.

Суффикс -ов указывает на русскую модель образования фамилии: «чей?» — Шайдоров, то есть сын или потомок Шайдора. Такие фамилии массово возникали у крещёных татар, башкир, казахов и других народов, входивших в состав Российской империи, когда им давали русские по форме фамилии. Географически фамилия чаще всего встречается в Оренбургской, Челябинской областях и в Башкортостане — регионах, где исторически плотно пересекались русское и тюркское население.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с арабским словом «шайхид» (святой, мученик за веру), которое через тюркское посредничество могло превратиться в «шайдар». Однако для прозвища, ставшего фамилией, такое значение слишком сакрально — в быту скорее давали бытовые, а не религиозные прозвища. Поэтому версия с «удальцом» убедительнее.

Фамилия Шайдоров не принадлежит к широко распространённым, но и не единична. Её носители — это потомки тюркских народов, которые в XVII–XIX веках переходили в православие и получали фамилии по прозвищам предков. В написании встречается вариант Шайдаров (с буквой а во втором слоге) — это не ошибка, а диалектное произношение, закрепившееся в документах.