Фамилия Шайхаатаров — один из тех случаев, когда написание подсказывает происхождение лучше, чем произношение. Двойное «а» в середине — не опечатка и не случайность, а указание на составную основу. Фамилия образована от арабско-тюркского имени Шайхаатар, где первая часть «шайх» (араб. شيخ) означает «старейшина», «предводитель», «мудрец», а вторая — «аатар» — восходит к тюркскому «атар» (лекарство, снадобье) или арабскому «атар» (след, влияние). В сумме имя можно перевести как «старейшина-лекарь» или «тот, чьё влияние подобно лекарству». Суффикс «-ов» — стандартный русский патронимический показатель, закрепляющий фамилию за потомками человека с таким именем.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически смешивались тюркские и арабские ономастические традиции: Татарстан, Башкортостан, отчасти Казахстан и Средняя Азия. В русских документах XIX — начала XX века такое имя могли записать как Шайхатар, но двойная «а» в корне — более точная фиксация исходного произношения, когда гласные на стыке частей имени не сливались. Фамилия редкая, её носители — почти наверняка потомки мулл, лекарей или уважаемых старейшин, так как имя Шайхаатар давали в семьях с религиозным или врачевательным уклоном.

Сравните с однокоренными фамилиями: Шайхутдинов (шайх + религия), Шаймарданов (шайх + храбрый) — везде первая часть та же, а вторая уточняет качество или занятие. У Шайхаатарова уникальность в том, что вторая часть отсылает к врачеванию, а не к вере или войне. Это сразу выделяет фамилию среди «шайховских»: предок носителя был не просто уважаемым человеком, а, вероятно, практикующим знахарем или народным целителем, чьё прозвище приросло к роду.

Встречаются варианты написания без удвоения — Шайхатаров, но это уже результат упрощения при паспортизации. Исходная форма с двумя «а» грамматически точнее отражает структуру: Шайх-аатар-ов, где каждый элемент несёт смысл. Если вы носитель этой фамилии, то с большой вероятностью ваши предки жили в среде, где арабская книжная культура сочеталась с тюркской устной традицией — типичная ситуация для волго-уральского региона.