Основой фамилии Щемелинин послужило мирское имя Щемелина. Нецерковное имя Щемелина восходит к слову «щемелина»: так в южных говорах называли медуницу, а также растение горлянку. Давая младенцу такие имена, как, например, Волк, Белка, Соловей, Щемелина, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного или растительного мира. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Щемелина, со временем получил фамилию Щемелинин.