Фамилия Шеботкин — из тех, что хранят в себе неочевидную, но живую историю. Её основа — не имя и не ремесло, а прозвище или диалектное слово, что сразу делает её интересной для этимолога.

Корень здесь — «шебот» или «шебота». В русских говорах, особенно южных и рязанских, «шеботать» означало шуметь, суетиться, хлопотать, а также ворчать или браниться. «Шеботун» — человек беспокойный, непоседливый или тот, кто постоянно что-то делает с шумом. Есть и другая, менее распространённая версия: в некоторых областях «шебот» называли вид обуви, что-то вроде грубого башмака, но она менее вероятна, так как фамилии от названий обуви в этой форме почти не встречаются. Правдоподобнее всего, что Шеботкин — потомок человека, получившего уличное прозвище Шебота за свой характер или манеру поведения.

Суффикс -кин указывает на принадлежность: Шеботкин буквально значит «сын Шеботы». Такая модель образования типична для русских фамилий от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а или -о. В этом фамилия схожа с однокоренными Шеботовым, Шеботаевым, Шеботниным, но именно форма с -кин привязана к конкретному прозвищу Шебота, а не к абстрактному понятию.

Географически фамилия тяготеет к средней полосе России и Поволжью. Наибольшая частота встречаемости — в бывших Рязанской, Тамбовской и Нижегородской губерниях, где слово «шебота» было в ходу. Это косвенно подтверждает народное происхождение: фамилия возникла в крестьянской среде, где прозвища давали метко и по делу. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — Шеботкины, скорее всего, из крестьян или мещан.

Особенность написания — редкое сочетание «шеб» в начале. В русской ономастике это не частый случай, что делает фамилию легко узнаваемой. Если убрать суффикс, остаётся чистое прозвище, которое уже не употребляется как имя, но живёт в фамильной памяти.