Фамилия Шендеряева — женская форма фамилии Шендеряев, и её разбор стоит начать с мужского варианта. Основа здесь — прозвище или имя Шендеряй, а суффикс -ев указывает на типичную русскую модель образования от прозвищ или имён на -ай, -ей. Такие суффиксы, как -яй, -ей в прозвищах часто имели уменьшительно-ласкательный или бытовой оттенок.

Корень «шендер» — самый интересный и неочевидный. Скорее всего, это искажённое или адаптированное на русской почве еврейское имя Шендер (вариант Александра на идише: Шендер — от «Шендл» или «Сендер»). В среде еврейских переселенцев на юге и западе Российской империи такие имена нередко превращались в фамилии с русскими суффиксами. Версия с тюркским корнем (например, от «шен» — радость, или «шенлик» — праздник) менее вероятна, так как суффикс -яй нехарактерен для тюркских прозвищ, а вот для славянизированных еврейских имён — вполне.

Географически фамилия Шендеряев встречается в основном в центральной России, особенно в Курской, Воронежской и Тамбовской областях, что совпадает с зонами, где в XIX веке оседали еврейские земледельческие колонии. Носители фамилии могли быть потомками крещёных евреев или тех, кто сменил веру при получении фамилии по указу 1804 года.

Есть и более редкая, но допустимая версия: от диалектного глагола «шендерить» (в некоторых говорах — шататься, болтаться без дела). Тогда Шендеряй — прозвище непоседы или лодыря. Однако эта версия слабее, потому что глагол малораспространён и не зафиксирован в авторитетных словарях русских говоров как основа для фамилий. Правдоподобнее считать, что перед нами пример адаптации личного имени через прозвищную форму, что типично для многонациональной периферии империи.