Фамилия Шепенок — редкий образец восточнославянской модели с суффиксом -ок, который в белорусской и украинской традиции часто указывал на молодого человека или сына: Шепенок буквально значит «маленький Шепа» или «сын Шепы». Основа Шеп- восходит к прозвищу, которое могло звучать как Шепа или Шеп. В украинских и южнорусских говорах «шепать» означало «шептать», «говорить тихо», поэтому прозвище Шепа давали человеку с тихим голосом, неразговорчивому или тому, кто говорил шёпотом. Есть и вторая, менее вероятная версия: в польском языке «szczepić» — «прививать», а «szczep» — «побег, отросток», и фамилия могла возникнуть от основы Щеп- с переходом звука в Ше- в диалектах. Но первая версия про шёпот выглядит логичнее и проще.

Географически фамилия Шепенок встречается в основном на западе современной России — в Смоленской, Брянской областях, а также в Беларуси и на Украине. Это типичный ареал белорусского влияния на русские фамилии, где суффикс -ок сохранился как уменьшительная форма. В сословном отношении предки Шепенков, скорее всего, были крестьянами или мещанами — фамилии с такой моделью редко встречались среди дворянства.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Шепенок стоит в одном ряду с Шепель, Шептунов, Шепетовский — все они так или иначе связаны с тихой речью или манерой говорить. Но Шепенок отличается именно суффиксом, который делает фамилию «младшей» по происхождению: она могла появиться, когда отца звали Шепа, а его сына — Шепенок. Со временем прозвище закрепилось как наследственная фамилия.

Написание фамилии устойчивое, без вариантов — через «е» после шипящего, что характерно для белорусской орфографии. В русском языке ударение, скорее всего, падает на второй слог: Шепе́нок.