Фамилия Шергунова — женская форма фамилии Шергунов. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Шергун, которое, скорее всего, связано с диалектным глаголом «шергунить» — так в некоторых русских говорах, особенно на севере и в Сибири, называли скрести, тереть, чистить или издавать шуршащий, скребущий звук. Человек с таким прозвищем мог получить его за манеру речи (картавость, шепелявость), за привычку шаркать ногами при ходьбе или за род занятий — например, за работу с кожей или деревом, где требовалось скоблить и шероховатить поверхность.

Модель образования фамилии проста и архаична: к основе Шергун добавили типичный русский патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность к роду («чей?» — Шергунов сын). Такая схема была массовой в XVI–XVII веках, когда фамилии формировались в среде крестьян и посадских людей. Интересно, что корень «шерг-» встречается и в других фамилиях — Шергин, Шерганов, — но Шергунов выделяется суффиксом -ун, который в русском языке часто придаёт слову оттенок активного действия или характерного признака (ср. «болтун», «крикун», «врун»). То есть Шергун — это не просто «тот, кто шергунит», а «тот, кто делает это постоянно, обладатель яркой черты».

Географически фамилия Шергуновых тяготеет к северным и центральным регионам России: она устойчиво фиксируется в переписях Архангельской, Вологодской, Костромской и Нижегородской губерний. Встречается и у донских казаков, что может говорить о миграции носителей в южные области. В документах XVII века попадаются крестьяне Шергуновы из Тотемского уезда — это подтверждает северное происхождение. Сословно фамилия почти наверняка крестьянская или посадская: дворянских родов Шергуновых в «Бархатной книге» и других родословных сборниках нет.

Есть и менее очевидная версия: Шергун могло быть тюркским именем или прозвищем, адаптированным на русской почве. В тюркских языках корень «шер» или «шир» означает «лев», а «гун» — «день», но такое сложение для личного имени маловероятно. Правдоподобнее, что это переосмысление татарского слова «шеркеш» (строптивый, упрямый) или «шерен» (ловкий). Однако в русском контексте диалектная версия остаётся основной: она объясняет и форму, и семантику без натяжек.

Итоговое значение фамилии — «принадлежащий Шергуну, потомок Шергуна». Скорее всего, предок носительницы фамилии был человеком с заметной речевой или бытовой особенностью, либо занимался ремеслом, связанным с обработкой материалов «на шергун».