Фамилия Шевгенин — редкая и неочевидная для поверхностного взгляда. Её основа — Шевгеня — в современном русском языке не встречается, и это сразу указывает на то, что корни фамилии либо диалектные, либо иноязычные. Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Шевгени). Значит, в основе лежало личное прозвище или имя Шевгеня.

Самая правдоподобная версия выводит Шевгеню из тюркских языков. В них корень «шев» или «шеф» может быть связан с понятием «красивый», «изящный» (ср. татарское «чибәр» — красивый), а формант -геня — уменьшительное или ласкательное окончание, характерное для тюркских прозвищ, адаптированных в русской среде. Таким образом, Шевгеня могло означать «красавчик», «щеголь» — прозвище, данное человеку за опрятный вид или любовь к нарядам. В пользу тюркского происхождения говорит и географическая привязка: фамилия встречается в Поволжье и на Урале, в зоне активных русско-татарских и русско-башкирских контактов.

Альтернативная, но менее вероятная версия связывает фамилию с украинским или белорусским диалектным словом «шевга» — так могли называть сварливого или суетливого человека. Однако эта гипотеза слаба: суффикс -енин (как в «Шевгенин», а не «Шевгенко») указывает скорее на северное или восточное, а не на юго-западное происхождение. Если бы основа была украинской, мы бы с большей вероятностью увидели фамилию Шевгенко или Шевгень.

Примечательная деталь: в фамилии Шевгенин нет суффикса -ов, самого массового в русской ономастике. Формант -ин чаще встречается в северных и центральных регионах России, но в сочетании с тюркской основой он выдаёт смешанный культурный фон. Предок носителя фамилии, скорее всего, был крещёным татарином или башкиром, получившим прозвище в русской деревне, или же русским крестьянином, жившим в соседстве с тюрками и перенявшим у них прозвище. Точных сведений о сословной принадлежности Шевгениных нет, но по встречаемости фамилия остаётся малочисленной — это не дворянский род и не распространённая крестьянская фамилия, а скорее локальное прозвище, закрепившееся в одном-двух родах.