Фамилия Шевгеня — редкая и, скорее всего, искусственная по происхождению. Её основа не связана с древнерусскими прозвищами или ремёслами, а указывает на конкретный исторический контекст: это одна из фамилий, возникших в среде духовенства. В семинариях в XVIII–XIX веках будущим священникам нередко давали «говорящие» фамилии, образованные от латинских или греческих слов, призванные подчеркнуть добродетель или качество.

Фамилия Шевгеня восходит к латинскому слову saevus — «свирепый», «грозный», «жестокий». В латинском языке есть прилагательное saevigena (буквально «рождённый свирепым», «суровый от природы»). Именно это слово и легло в основу фамилии, но в русской передаче оно подверглось фонетическому упрощению: потеря начального слога и замена окончания на типичное восточнославянское «-я». Так латинское saevigena превратилось в Шевгеню.

Важно понимать, что для носителя латыни такое прозвище звучало бы негативно, но в семинарской среде его могли дать с оттенком иронии или как «учёное» имя, демонстрирующее знание языка. В отличие от фамилий от названий животных или профессий, Шевгеня — книжная, «кабинетная» фамилия, которую не могли получить крестьяне или ремесленники в быту. Её носители — почти наверняка потомки священнослужителей, выпускников духовных училищ.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским землям, где семинарские фамилии были особенно распространены. Встречается она крайне редко, что подтверждает её происхождение: массовой она не стала, потому что её давали только в одном или нескольких учебных заведениях. Если искать аналоги, то Шевгеня стоит в одном ряду с фамилиями вроде Сперанский (от spero — «надеюсь») или Бенедиктов (от benedictus — «благословенный»), но с противоположным, «грозным» значением.

Таким образом, фамилия Шевгеня — это не прозвище предка-воина или разбойника, а учёное имя, данное семинаристу за успехи в латыни или просто по прихоти наставника. Её обладатели — выходцы из духовного сословия, и сама фамилия — маленький памятник русской семинарской традиции, где латынь была вторым родным языком.