Фамилия Шфйхутдинова выглядит как результат искажения или опечатки. В русской ономастике нет устоявшейся фамилии с таким сочетанием согласных «шфй». Скорее всего, перед нами ошибка при записи или передаче фамилии в документы, и исходная форма — Шайхутдинова или Шейхутдинова.

Если восстанавливать наиболее вероятный вариант, то фамилия Шайхутдинова образована от тюркско-арабского имени Шайхутдин (или Шейхутдин). Это сложное имя: первая часть «шайх» (араб. «старейшина», «глава», «наставник») в тюркской среде часто означала уважаемого религиозного деятеля, вторая — «ад-дин» (араб. «веры», «религии»). Вместе имя можно перевести как «старейшина веры» или «наставник в религии». Суффикс «-ова» — русский патронимический показатель, указывающий на принадлежность к роду (дочь или жена Шайхутдина). Таким образом, предок носительницы фамилии был человеком, чьего отца или деда звали Шайхутдин.

Фамилии этого типа широко распространены у татар, башкир и других народов Поволжья и Урала, принявших ислам. Поскольку имя Шайхутдин давали в семьях, где ценили религиозное образование, предки могли быть муллами, учителями при мечети или просто глубоко верующими людьми. Встречаются и русские варианты написания: Шейхутдинов, Шайхутдинов, реже — Шайхутдинова. Вариант с «й» после «ш» (Шфйхутдинова) — почти гарантированная опечатка, возникшая при неверном считывании рукописного текста или при автоматическом распознавании.