Фамилия Шайхутдинов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Шайхутдинов уходит в XV-XVII вв. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Шайхутдинов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Фамилия Шайхутдинов образована от мусульманского мужского имени Шайх, которое переводится на русский язык как «старец, духовный глава», и арабского элемента «дин» в значении «религия, вера», часто присоединяемого к восточным фамилиям. Подобная фамилия, по данным различных источников, была распространена в Узбекистане. Скорее всего, она принадлежала отпрыску известной династии служителей культа и религиозных деятелей. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Шайхутдинов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Тем не менее, фамилия Шайхутдинов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.