Фамилия Шибкин образована по типичной русской модели: к основе «шибк» добавили суффикс -ин, который указывает на принадлежность. Буквально Шибкин — «чей?» — сын или потомок человека по прозвищу Шибка или Шибок. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще давали по отцу (Иванов, Петров), суффикс -ин в старину закреплялся за основами, оканчивающимися на -а, -я, а также за прозвищами, образованными от глаголов и прилагательных.

Корень «шибк» восходит к древнерусскому глаголу «шибать» — бить, ударять, кидать. В русских говорах «шибкий» означало «бойкий, скорый, резкий». Прозвище Шибка могли дать человеку с быстрым нравом, вспыльчивому, либо тому, кто работал с размахом — например, косарь или молотобоец. В рязанских и тамбовских говорах «шибан» — это ловкач, пройдоха, но вряд ли прозвище несло резко отрицательный оттенок: фамилии от «шибать» встречаются нередко и без уничижительного смысла.

Есть и другая версия, более редкая: Шибкин мог образоваться от тюркского слова «шибк» (шайба, клин) или от диалектного «шибка» — стекло, но она слабая. Ни в одном из авторитетных ономастиконов (Унбегаун, Никонов, Веселовский) нет указаний на тюркские корни для этой фамилии. Правдоподобнее всего — славянское прозвище от глагола.

Географически фамилия Шибкин тяготеет к центральным и южным областям России. В XIX веке она чаще всего фиксировалась в Воронежской, Тамбовской и Саратовской губерниях. Встречается и на Украине, но как редкая — там её могли занести переселенцы из великорусских губерний. Среди однокоренных фамилий — Шибаев, Шибанов, Шибков, Шибановский. Все они идут от того же «шибать», но с разными суффиксами.

Сословная принадлежность носителей фамилии неоднородна. В ревизских сказках XVIII–XIX веков Шибкины числятся и среди государственных крестьян, и среди однодворцев (потомков служилых людей «по прибору»). Дворянских родов с такой фамилией не известно — в «Общем гербовнике» её нет. Значит, предки Шибкиных — крестьяне или мелкие служилые люди, чья фамилия закрепилась не по имени, а по уличному прозвищу.