Фамилия Шилига звучит непривычно для русского уха, и это не случайно. Её ядро — южнорусское или украинское слово «шилига», которое в диалектах означало «прут», «хворостина», «розга». Человек мог получить такое прозвище за сухое, жилистое телосложение, за строгий нрав или просто за привычку ходить с прутом. Вторая, менее очевидная версия, связывает фамилию с глаголом «шилить» — в некоторых говорах так говорили о быстром, колючем взгляде или о резком движении. Тогда Шилига — «тот, кто шилит», то есть пронзает взглядом, острый на язык.

Словообразовательная модель здесь редкая и архаичная: суффикс -иг(а) придаёт слову оттенок фамильярности или пренебрежения, как в «слупига» или «скрябига». Такие прозвища в XIV–XVI веках легко закреплялись за крестьянами и ремесленниками, минуя официальную фамильную форму на -ов. Фамилия Шилига могла остаться в неизменном виде именно потому, что её носители долго жили в среде, где патронимические суффиксы не приживались — например, в казачьих станицах или на пограничье России и Речи Посполитой.

Географически фамилия тяготеет к юго-западу: её следы фиксируются в старых переписях Черниговщины, Полтавщины, а также в Белгородской и Курской областях. Встречается она нечасто, что указывает на локальное происхождение — возможно, от прозвища одного родоначальника, давшего начало небольшому роду. В словарях Б. Унбегауна и В. Никонова эта фамилия не упоминается в числе распространённых, что подтверждает её узкорегиональный и диалектный характер.

Интересно, что в некоторых говорах «шилига» имела и второе значение — «шило», то есть инструмент сапожника. Это допускает и профессиональную версию: предок мог быть мастером по кожевенному делу. Однако фонетически слово «шилига» ближе к «пруту», чем к «шилу», поэтому прозвищное происхождение от внешности или характера кажется более надёжным.