По одной из версий, фамилия Шильцин происходит от топонима Шильцы: так называется деревня в Сергиево-Посадском районе Ярославской области. Возможно, основатель рода Шильциных был выходцем из этой деревни. Согласно другой гипотезе, в основе этой фамилии лежит прозвище Шильце, образованное от глагола «шить». Соответственно, оно могло относиться к числу «профессиональных» именований, указывающих на род занятий предка. Так, основатель рода Шильциных мог быть портным. Менее вероятной представляется другая гипотеза: фамилия Шильцин происходит от нецерковного мужского личного имени Шильце (уменьшительная форма имени Шило, которое было нередким у русских вплоть до конца XVII века). Вероятно, нарекая ребенка таким именем, родители рассчитывали, что их отпрыск будет отличаться ловкостью, пронырливостью или красноречием (то есть языком острым, как шило). Именование Шило встречается в документах с XV века. Веселовского записаны Иван Васильевич Шило Кучецкий, умер около 1485 года; князь Андрей Юрьевич Шило Шелешпанский, 1495 год. Так, в архивах пензенского общества «Мемориал» записан Шильцин Василий Михайлович, который родился в 1882 году (Пензенская обл., Сердобский р-н, с. Пригородная Слобода). В Книге памяти Республики Башкортостан отмечен Шильцин Михаил Андреевич, рожденный в 1907 году в деревне Ильинка Стерлитамакского района Башкирии. А в Книге памяти Республики Мордовия упоминается Шильцина Евдокия Ивановна, рожденная в 1889 году в селе Манадыши.