Фамилия Шилягин — один из тех случаев, когда за привычным русским суффиксом -ин скрывается неочевидная основа. Вопреки первому впечатлению, она едва ли связана с глаголом «шить» или профессией портного. Словообразовательная модель здесь типична для северных и сибирских говоров: суффикс -яг(-а) образовывал прозвища и имена по характерному признаку или действию (сравните: гуляга, работяга, бедняга). Основа «шил-» в этом случае восходит не к шитью, а к древнерусскому глаголу «шити» — не просто «шить», а «колоть, тыкать, пронзать». В диалектах «шиляга» или «шиляка» — это колючка, заноза, а в переносном смысле — задиристый, приставучий, колкий человек. Именно такое прозвище и стало основой для фамилии: Шиляга — колючий, неуживчивый человек, затем Шилягин — потомок Шиляги.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с тюркским именем Шиля (в ряде языков «шиля» — «дарованный» или «подарок»). В пользу этой гипотезы говорит то, что фамилия встречается в Поволжье и на Южном Урале, где исторически были сильны тюркские влияния. Однако русская модель с суффиксами -яг-/-як- встречается чаще, и именно она объясняет «акающее» произношение (Шилягин, а не Шилегин).

Географически фамилия Шилягин — редкая, с заметным пятном в Вологодской и Архангельской областях, а также в Пермском крае. Это подтверждает версию о севернорусском диалектном происхождении: именно в этих краях слово «шиляга» в значении «заноза» фиксируется этнографами. Сословно фамилия не была привилегированной: в документах XIX века Шилягины числятся в основном среди государственных крестьян и мещан. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Интересная деталь: в старых переписях встречается вариант написания «Шилякин» — с заменой «г» на «к», что характерно для некоторых северных говоров, где оглушение конечного согласного было нормой. Это лишний раз указывает на устный, а не книжный путь возникновения фамилии: её записывали со слуха, а не выводили из церковного календаря. Так что предки современных Шилягиных, скорее всего, жили в лесной или приречной полосе Русского Севера и получили прозвище за характер — колкий, острый на язык, неуступчивый.