Фамилия Шиндинов — редкая и интересная с точки зрения словообразования. Её основа, Шиндин, восходит к прозвищу или имени, а суффикс -ов указывает на стандартную русскую патронимическую модель: «чей?» — «Шиндинов», то есть сын или потомок Шиндина.

Самая вероятная версия происхождения корня — тюркская. В тюркских языках слово «шин» (şın, şin) имеет несколько значений: «правда», «истина», «подлинность» (например, в казахском, татарском). Прибавление аффикса -ды/-ди образует прилагательное со значением «обладающий качеством», то есть Шинди — «правдивый», «истинный». Таким образом, Шиндин могло быть личным именем или прозвищем человека, которого ценили за честность и прямоту. Суффикс -ин в русской адаптации тюркских имён встречается часто (сравните: Шамшин, Якушин) и фактически выполняет роль формального показателя принадлежности, сливаясь с основой.

Вторая, менее распространённая гипотеза связывает фамилию с географическим названием. В Бурятии и Забайкалье есть урочища и речки с корнем «шин» (например, река Шинда), что может указывать на происхождение от топонима. Однако в таком случае ожидалась бы форма Шиндиновский или Шиндинский, а не Шиндинов, поэтому версия с личным прозвищем выглядит убедительнее.

Географически фамилия Шиндинов встречается в основном в южных регионах России — в Астраханской области, Калмыкии, а также в Казахстане. Это подтверждает её тюркские корни: на Нижней Волге и в Прикаспии веками жили тюркоязычные народы (ногайцы, татары, казахи), у которых подобные имена были обычны. Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к казачеству или крестьянству — в дворянских родословных книгах Шиндиновы не значатся.

В написании фамилии возможна путаница: вариант Шендинов (через «е») встречается реже, но фиксируется в документах. Это, вероятно, результат диалектного произношения, где «и» и «е» в безударном положении звучали одинаково.