Фамилия Шипинский образована от аналогичного прозвища, которое восходит к названию местности Шипинки (Винницкая область, Украина), Шипино (Новгородская,Ярославская, Ленинградская области). Соответственно, именование Шипинский закрепилось за уроженцем поселения с подобным названием.