Фамилия Ширунов, как и многие русские фамилии, образована от прозвища или имени предка. В её основе лежит слово «ширун», которое, скорее всего, имеет диалектное или профессиональное происхождение.

Самый вероятный вариант — связь с глаголом «ширить» (расширять, делать широким). В этом случае «ширун» — это прозвище человека, который занимался расширением чего-либо: например, прокладывал дороги, расчищал лес под пашню или расширял угодья. В северных и сибирских говорах «ширить» могло означать «тратить, сорить деньгами», так что прозвище могло закрепиться за человеком нерасчётливым, живущим на широкую ногу. Вторая версия, менее распространённая, возводит фамилию к тюркским корням: в некоторых тюркских языках «шир» означает «лев», и «ширун» могло быть прозвищем храбреца или воина. Однако для русской фамильной модели эта гипотеза слабее — она не объясняет суффикс «-ун», типичный для русских прозвищ, и не подтверждается географией фамилии.

Суффикс «-ун» в русском языке активно использовался для образования прозвищ по действию (крикун, молчун, бегун). От такого прозвища «Ширун» с помощью стандартного патронимического суффикса «-ов» и возникла фамилия — «сын Шируна». Притяжательная форма «Ширунов» закрепилась в документах и стала наследственной.

Фамилия Ширунов не относится к числу аристократических или дворянских. Скорее всего, предки носителя фамилии были крестьянами или посадскими людьми, получившими прозвище за характерную черту — склонность к расширению своих владений, хозяйственную жилку или, наоборот, за мотовство. Встречается фамилия преимущественно в центральных и северных областях России, а также в Поволжье, что косвенно подтверждает её славянское происхождение.

В ономастических справочниках фамилия Ширунов не получила широкого освещения, что говорит о её сравнительной редкости. Это не мешает ей быть прозрачной для этимологического разбора: перед нами типичный пример русской фамилии, которая хранит в себе живое слово из народного языка, вышедшее из активного употребления.