Фамилия Шишаркин — одна из тех русских фамилий, где за простым звучанием скрывается неочевидная этимология. На первый взгляд она похожа на отчество от имени или прозвища Шишарка, но корень здесь сложнее, чем кажется.

Самый вероятный источник — прозвище Шишарь. В русских диалектах, особенно в северных и сибирских говорах, «шишарь» — это не только тот, кто делает шишки (промысел кедровых орехов), но и вообще человек, занимающийся сбором шишек или торговлей ими. Суффикс -кин указывает на принадлежность: Шишаркин — «чей?» — сын, потомок Шишаря или Шишарки. Модель образования типична для русских фамилий XVI–XVII веков, когда отчество на -ин закреплялось за потомками человека с прозвищем, оканчивающимся на -а/-я.

Менее распространённая, но возможная версия связывает фамилию с именем Шишарка — уменьшительной формой от канонического имени Сисиний (редкое, но встречавшееся в святцах). В народном произношении Сисиний нередко превращался в Шишан, Шишара, а оттуда — в Шишарка. Однако эта гипотеза слабее: прозвищная версия объясняет фамилию проще и без натяжек, к тому же промысловые прозвища давали гораздо чаще, чем использовали редкое имя.

Географически фамилия тяготеет к центральным и поволжским областям России, встречается в старых переписях Пензенской и Тамбовской губерний. Именно там в XVIII–XIX веках был развит сбор кедрового ореха и торговля им, что косвенно подтверждает «ремесленную» версию. В отличие, скажем, от фамилии Шишкин, где основа — «шишка» (шишка на теле или прозвище важного человека), Шишаркин почти наверняка сохранила память о конкретном занятии: предок был не просто «шишкарем», а человеком, чей промысел дал прозвище всему роду.

Словообразовательно фамилия стоит в одном ряду с такими же «профессиональными» фамилиями на -кин: Кожаркин (кожевник), Пекаркин (пекарь), Сахаркин (сахаровар). Суффикс -арь в основе (шиш-арь) указывал на деятеля по роду занятий, а затем фамильный суффикс -ин закрепил принадлежность к этому роду. Таким образом, Шишаркин — не случайное созвучие, а прозрачный след крестьянского или посадского быта, где прозвище по ремеслу становилось фамилией на поколения.