Фамилия Шишев — короткая, на слух простая, но её происхождение неочевидно. Первое, что приходит в голову — связь со словом «шишка». Но тут важно разобраться, какой именно смысл лёг в основу, потому что у этого слова в русском языке несколько значений, и каждое ведёт к разной истории предка.

Самая вероятная версия — прозвище Шиш, от которого через притяжательный суффикс -ев образовалась фамилия. В старину «шишом» называли не только лесную шишку, но и остроголовый предмет, шип, а также — в переносном смысле — бойкого, пронырливого человека, вора или разбойника. В словаре Даля «шиш» — это ещё и бродяга, беглый, а также лазутчик, соглядатай. Прозвище могли дать человеку с характерной внешностью (например, с шишкой на голове или высоким теменем) либо за поведение — задиристому, юркому или тому, кто промышлял не самым честным ремеслом. В пользу этой версии говорит то, что фамилии на -ев, образованные от прозвищ, — самый массовый тип русских фамилий, и Шишев вписывается в этот ряд.

Менее распространённая, но тоже возможная версия — от слова «шиш» в значении «шишка» как начальник, важное лицо. В народной речи «большая шишка» — человек при власти. Однако прозвища с таким значением обычно давались иронично, мелкому начальнику, а не крупному сановнику. Вряд ли фамилия Шишев ведёт начало от действительно высокого чина — скорее от местного старосты или приказчика, которого в глаза величали, а за глаза посмеивались.

Суффикс -ев, а не -ов, указывает на то, что основа оканчивается на мягкий или шипящий звук: Шиш → Шишев. Такая модель типична для русских фамилий центральных и северных губерний. Географически фамилия Шишев встречается нередко, но не массово — её можно найти в Поволжье, на Урале и в Сибири, что говорит о расселении носителей с Русского Севера или из центральных областей.

Встречается и омонимичная фамилия Шишов — с тем же корнем, но иным суффиксом. Шишев отличается именно формой притяжательности: если Шишов — «чей?» — сын Шиша, то Шишев — то же самое, но с историческим чередованием. Разница чисто фонетическая и диалектная, не смысловая.

Таким образом, ваш предок по фамилии Шишев скорее всего получил прозвище Шиш — за внешность, характер или род занятий. Это не дворянская и не церковная фамилия, а народная, бытовая, что типично для большинства русских фамилий. Точное значение можно сузить, только зная местные говоры и семейные предания, но общая картина ясна: за фамилией стоит живой человек, которого когда-то так прозвали окружающие.