Фамилия Шишук — яркий пример восточнославянской модели фамилий на -ук/-юк. Этот суффикс, характерный прежде всего для украинской и белорусской ономастики, указывает на принадлежность к роду: Шишук буквально значит «маленький Шиш» или «потомок Шиша». Исходное прозвище Шиш в народной среде имело несколько значений. Самое прямое — «шип», «колючка», «острый предмет». Но чаще прозвище давали человеку невысокого роста, юркому или, наоборот, скупому и прижимистому — в диалектах «шиш» означало и «нищий», и «плут», и «лазутчик». В некоторых говорах «шишом» называли домового или черта, так что прозвище могло иметь и обережную, охранительную функцию.

География фамилии Шишук подтверждает её украино-белорусское происхождение. Наибольшая концентрация носителей традиционно фиксируется в западных и центральных областях Украины — Волыни, Подолье, Житомирщине, а также в юго-восточных районах Беларуси (Брестская, Гомельская области). В России фамилия встречается реже и рассеяна, что типично для фамилий, принесённых миграционными волнами в XIX–XX веках.

Интересная деталь: в отличие от более частых фамилий Шишкин или Шишков, где суффиксы -ин и -ов указывают на прямую принадлежность («чей?»), фамилия Шишук по модели образования ближе к фамилиям типа Ковальчук или Бондарчук — она не просто называет предка по прозвищу, а подчёркивает его младшую ветвь рода. То есть Шишук — это не «сын Шиша» в прямом смысле, а скорее «малый Шиш», что вносит дополнительный оттенок уменьшительности или даже ироничности в исходное прозвище.

В ономастических справочниках фамилия Шишук обычно не получает развёрнутого толкования из-за своей относительной редкости, но её разбор укладывается в общую схему, описанную в работах Б. Унбегауна и В. Никонова: украинские фамилии на -ук/-юк массово формировались в XV–XVII веках, преимущественно среди казачества и крестьянства. Социальный статус предков Шишуков, скорее всего, был крестьянским или ремесленным — знать такие модели не использовала.