По одной из версий, оно ведет свое начало от нарицательного «шиша», которое в пермских говорах имело значение «бедный люд». Вероятно, прозвище Шишенок отражало социальное и материальное положение основателя фамилии: его мог получить небогатый человек. В таком случае прозвище Шишенок содержало указание либо на особенности места жительства предка (на возвышенности), либо на род его деятельности (крестьянин-земледелец или сенокосец). Соответственно, Шишенком могли прозвать медлительного, нерасторопного человека.