Фамилия Шишинов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Шишинов послужило мирское имя Шишай. Фамилия Шишинов образована от мирского имени Шиша или Шишуй. Не следует также исключать возможность происхождения фамилии Шишинов от прозвища Шишай, восходящего к диалектному глаголу «шишать», то есть «копаться, мешкать, лениво, неловко делать что-то». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Шишай, со временем получил фамилию Шишинов. О точном месте и времени возникновения фамилии Шишинов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Шишинов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.