Фамилия Шишева — женская форма от Шишев, и её происхождение прозрачнее, чем кажется на первый взгляд. В основе лежит слово «шиш» — не то, что вы могли подумать, а старинное русское прозвище. В диалектах «шишом» называли вора, мошенника или озорника, но чаще — лазутчика, соглядатая, а то и лешего (в северных говорах). Прозвище могли дать человеку неспокойному, хитрому или тому, кто любил прятаться, подглядывать. Фамилия образована по стандартной патронимической модели: от прозвища Шиш через притяжательный суффикс -ев (фонетически закономерное -ев после шипящего) — то есть «сын Шиша».

Менее вероятная, но возможная версия ведёт к слову «шишка». В этом случае Шишев — потомок человека, которого прозвали Шишкой за важность, шишковатость на теле или за то, что он собирал шишки (лесной промысел). Однако форма «Шишев» проще и естественнее выводится именно от «шиш», поскольку суффикс -ев присоединяется к основам на шипящий, а «шишка» дала бы фамилию Шишкин. Спор здесь небольшой: ономасты (например, Б. Унбегаун в «Русских фамилиях») прямо указывают, что фамилии типа Шишев, Шишов, Шишаев восходят к прозвищу Шиш, а не к шишке.

Географически фамилия Шишева встречается рассеянно, без ярко выраженного гнезда — это типичная «прозвищная» фамилия, которая могла возникнуть в любом регионе России. В дореволюционных переписях Шишевы фиксировались среди крестьян и мещан, особенно в центральных губерниях и на Урале. Суффикс -ев указывает на великорусское происхождение, а не на украинское или белорусское (там чаще встречается Шишко или Шишеня). Если ваш предок носил эту фамилию, скорее всего, он был потомком человека с неспокойным нравом или необычной внешностью — прозвища на Руси давали метко и без лести.