Фамилия Шишку — редкий случай, когда носитель почти наверняка происходит из определенного региона. Ее выдает окончание -у. В русской ономастике такие фамилии типичны для западных и юго-западных областей исторической России, прежде всего для Украины и Белоруссии. Это нестандартная форма, где суффикс принадлежности как бы «застыл» в предложном или местном падеже: буквально «из дома Шишка» или «принадлежащий Шишку». В великорусских говорах фамилию давно бы переделали в Шишкин.

Основа фамилии — прозвище Шишко. В старину «шишкой» называли не только лесной плод, но и человека: бойкого, задиристого, либо того, кто «шишка» — то есть важная персона, начальник. В диалектах встречалось и значение «нищий, попрошайка» (от глагола «шишкать» — шататься, просить). Какое из значений стало источником прозвища конкретного предка, сегодня не определишь, но оба бытовали в крестьянской и казачьей среде.

Словообразовательная модель проста: к основе Шишк- добавлен суффикс -у, который в украинской и белорусской традиции заменяет русское -ов/-ев. Такие фамилии не склоняются по падежам в мужском роде (Иван Шишку, у Петра Шишку), что часто воспринимается как иностранное окончание. На деле это архаичная форма, сохранившаяся в южнорусских говорах.

Известных носителей с такой фамилией в открытых источниках почти нет, что подтверждает ее редкость. Если вы носите фамилию Шишку, ваши предки с высокой вероятностью жили на территории современной Украины, в южных областях России или в восточной Белоруссии. Прозвище Шишко мог получить либо видный сельский староста, либо, наоборот, человек с неспокойным нравом — в любом случае, прозвище было заметным и закрепилось в роду.