Фамилия Шкадун — редкая и звучит не по-русски. В её основе почти наверняка лежит прозвище, образованное от украинского или белорусского слова. Суффикс -ун характерен для восточнославянских фамилий, образованных от глаголов: он указывает на деятеля, того, кто постоянно совершает действие. Сравните: крикун, говорун, бегун. Шкадун — человек, который «шкадае», то есть делает шкоду.

В украинском и белорусском языках слово «шкода» означает вред, убыток, беду, а также шалость, проказу. «Шкодувати» — жалеть, сожалеть, но «шкодити» — вредить, портить, пакостить. Прозвище Шкада (или Шкода) давали либо озорнику и проказнику, от которого одни убытки, либо неудачнику, который сам часто терпел урон. Фамилия Шкадун, таким образом, — это «тот, кто шкодит», «вредник», «проказник». В польском языке, где «szkoda» значит то же самое, фамилия могла бы звучать как Шкодун, но написание через «а» выдаёт украинское или южнорусское произношение.

Географически фамилия тяготеет к западу и юго-западу бывшей Российской империи: Украина, Белоруссия, южные области России (Курская, Воронежская, Ростовская области). В этих краях фамилии на -ун встречаются чаще, чем в северных регионах. Носитель фамилии Шкадун, скорее всего, происходил из крестьянской или казачьей среды — прозвища такого рода редко давали людям привилегированных сословий.

Интересно, что фамилия сохранила архаичное ударение на последний слог — Шкаду́н, что тоже говорит о её народном, не книжном происхождении. Встречается вариант написания Шкодун, но он менее распространён. Так что, если вы Шкадун, ваши предки, скорее всего, были людьми с характером — не злыми, но живыми, за которыми водились шалости или невезение.