Фамилия Шкалин образована от прозвища Шкаля. По одной из версий, оно ведет свое начало от диалектного глагола «шкалять», который в воронежских говорах имел значение «скалить зубы», «шутить», а также «надсмехаться». Вероятно, Шкалей прозвали либо веселого, озорного, либо ироничного, колкого человека. Согласно другой гипотезе, прозвище Шкаля имеет схожую этимологию с нарицательным «шкали», значение которого В.И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет следующим образом: «накладные брусья на мачты и реи, для скрепы». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Шкаля относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог быть моряком или судостроителем. Так и прозвище Шкаля закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Шкалин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шкаля, со временем получил фамилию Шкалин.