Фамилия Шкелина — женская форма, мужской вариант — Шкелин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Шкела. Слово «шкела» в русских говорах имеет несколько значений, и это как раз тот случай, когда без географии не обойтись.

В архангельских и вологодских диалектах «шкела» — это мелкая рыбёшка, снеток или малёк. Прозвище Шкела могли дать невысокому, щуплому человеку или, с иронией, тому, кто промышлял мелкой рыбой. Но есть и другой вариант: в псковских и тверских говорах «шкела» — щепка, осколок, заноза. Здесь значение переносное — человек колкий, неуживчивый, «как заноза». Третья версия, менее вероятная, связывает фамилию с украинским «шкелити» — скалить зубы, насмехаться, но для русской фамилии это скорее исключение.

Модель образования проста и типична для северной и центральной России: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Шкелы). Такие фамилии чаще всего встречались в крестьянской среде, где прозвища были живыми и конкретными. Сословных перегородок эта модель не знала — Шкелины могли быть и крепостными, и государственными крестьянами, и посадскими людьми.

В современных адресных книгах Шкелины встречаются рассеянно, но заметный след оставили в Пермском крае и Кировской области — это зона бытования севернорусских говоров, где «шкела» в рыбном значении хорошо известна. Встречается фамилия и в Вологодской области, что подтверждает диалектную привязку.

Любопытно, что фамилия почти не имеет однокоренных «конкурентов»: Шкелёв, Шкелев встречаются редко и могут быть вариантами того же корня с другим суффиксом. Это делает Шкелиных носителями довольно редкого прозвищного имени, которое сохранило местное слово, почти ушедшее из живого языка.