Фамилия Шкилнюк — яркий пример украинской модели фамилии с типичным патронимическим суффиксом -ук/-юк. В украинской ономастике этот суффикс означает «маленький» или «потомок»: Шкилнюк — сын или потомок человека по прозвищу Шкилна, Шкило или Шкилня. Географически фамилия тяготеет к западным регионам Украины, особенно к Волыни, Ровенской и Житомирской областям, где суффикс -юк особенно распространён.

Корень шкил- — одна из самых интересных загадок фамилии. Наиболее вероятное объяснение ведёт к украинскому диалектному слову шкиль — «цыплёнок» или «птенец». В этом случае прозвище Шкиль (а Шкилнюк — его производное) могли дать человеку маленького роста, худощавому или юркому. В некоторых говорах «шкилем» называли также бедняка или бобыля — человека без хозяйства. Менее распространённая, но возможная версия связывает корень с польским szkiel — «стекло» (от нем. Scheibe), что могло указывать на профессию стекольщика, но для украинской среды это звучит натянуто.

Обратите внимание на редкую для украинских фамилий фонетику: сочетание шк в начале слова встречается нечасто и обычно заимствовано (школа, шкаф, шкода). Это добавляет фамилии выразительности и указывает на возможное влияние польского или немецкого языка через посредничество западноукраинских диалектов. В польском слове szkielko — «стёклышко», «очко» — тот же корень, что могло дать прозвище человеку в очках или с острым зрением.

Социально фамилия Шкилнюк, как и большинство фамилий на -ук/-юк, изначально принадлежала крестьянскому сословию. В Речи Посполитой такие фамилии закрепились за сельским населением в XV–XVII веках, когда фиксировали потомков по отцу. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это надёжный маркер простонародного происхождения. В письменных источниках фамилия встречается с XIX века, но, вероятно, бытовала в устной речи задолго до того.

При сравнении с однокоренными фамилиями (Шкиль, Шкиленко, Шкиляк) вариант Шкилнюк оказывается самым «западным» по форме. Если Шкиленко — типичное центральноукраинское образование, то Шкилнюк чётко указывает на Волынь или Полесье. В России фамилия редка и чаще всего встречается у потомков украинских переселенцев рубежа XIX–XX веков.