Фамилия Шкирич — южнославянская по своему происхождению, и её разумнее всего рассматривать в контексте сербской, хорватской или черногорской ономастики. Бросается в глаза суффикс -ич, который в этих языках является основным патронимическим (указание на отца или родоначальника). В русском языке аналогом был бы суффикс -ов/-ев, но в сербском модель «имя + ич» — стандартный способ образования фамилий, причём часто без дополнительных суффиксов.

Основа «Шкир-» вызывает несколько гипотез. Самая вероятная — связь с диалектным словом «шкира» (или «шкир»), которое в некоторых южнославянских говорах означает «щель», «расселина» или, в переносном смысле, «узкий проход». В таком случае прозвище Шкира мог получить человек, живший в ущелье или рядом с узким ущельем, либо, что менее вероятно, обладавший худощавым телосложением. Есть и другая версия: в черногорских и боснийских говорах «шкир» иногда называют человека с прищуром или косоглазием (от глагола «шкирити» — щуриться). Тогда фамилия отражала бы внешнюю примету предка.

Менее вероятно, но возможно, происхождение от антропонима Шкира — сокращённой формы какого-либо личного имени, например, Шкиро (гипокористика от имени, начинающегося на «Скр-» или «Шкр-»). Однако в этом случае основа остаётся тёмной, и версия с прозвищем кажется более надёжной.

Географически фамилия Шкирич наиболее характерна для региона Далмации и Герцеговины, а также встречается у сербов из Боснии. В России и Украине она — результат поздних миграций, поэтому не стоит искать её в древних русских боярских списках или казачьих реестрах. Социально предки Шкиричей, скорее всего, были крестьянами или пастухами, получившими фамилию по месту жительства или внешней особенности.

Сравнение с другими фамилиями: Шкирич стоит в одном ряду с такими же патронимическими образованиями, как Шкиль, Шкирко, Шкиренко (украинские варианты), но суффикс -ич однозначно указывает на балканский ареал. В русском языке фамилии на -ич обычно дворянские (Голицын, Оболенский) или белорусские, но Шкирич к ним не относится — это южный, народный тип.