Фамилия Шкирматов — яркий пример того, как русская фамилия может быть построена на тюркской основе. Её корень «шкирмат» восходит к тюркскому мужскому имени Шигермат (или Шикермат), которое в свою очередь образовано от двух слов: «шикер» (сахар) и «мат» (смерть). В буквальном переводе это имя означает «смерть сладка» или «сладкая смерть» — такая мрачная поэтика была вполне обычна для древних тюркских имён-оберегов. Именем Шигермат нарекали ребёнка, чтобы отвести от него настоящую смерть, обмануть злых духов: мол, смерть для него — сладость, а значит, она ему не страшна.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе «Шкирмат» добавили фамильный суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Шкирмата). Написание через «и» вместо «е» (Шкирматов, а не Шкерматов) — результат фонетической адаптации: в русском языке безударный «е» в заимствованных словах часто переходит в «и». Встречаются также варианты Шкерматов и Шикерматов, но Шкирматов — самый распространённый.

Географически фамилия тяготеет к южным регионам России — Поволжью и Приуралью, где веками происходило смешение русского и тюркского населения. Особенно много Шкирматовых в Оренбургской области, Татарстане и Башкортостане. Это указывает на то, что предки носителя фамилии, скорее всего, были крещёными татарами или башкирами, которые приняли православие, но сохранили родовое имя. Сословно Шкирматовы чаще всего относились к государственным крестьянам, реже — к однодворцам (особый разряд служилых людей на южных рубежах).

Примечательно, что фамилия Шкирматов не имеет никакого отношения к слову «шкварки» или «шкерты» — это народная этимология, которая возникает у носителей из-за созвучия. Настоящий корень лежит глубже, в тюркской ономастике, и прозвище «Шкирмат» для русского уха звучало экзотично, но именно эта необычность и помогла фамилии не затеряться среди тысяч других.