Фамилия Шкирынец — редкий пример восточнославянской фамилии, образованной по западноукраинской или белорусской модели. Её основа — прозвище Шкира, которое в юго-западных говорах означало «шкура», «кожа», причём чаще не в нейтральном, а в переносном смысле: так могли назвать худого, тощего человека («кожа да кости») или, наоборот, скупого, жадного («дерёт три шкуры»). Суффикс -ец типичен для фамилий Волыни, Подолья и Полесья: он указывал на принадлежность к роду или местности («сын Шкиры»). В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, где притяжательность прямая, модель на -ец подчёркивала скорее прозвищную характеристику рода.

В письменных источниках фамилия встречается с XVII века. В реестрах казацкой старшины и мещан Правобережной Украины фигурируют Шкиры, Шкиренко и Шкирынец — чаще всего в окрестностях Винницы, Житомира и Могилёва. Это позволяет предположить, что предки носителя фамилии были либо казаками (прозвище могло закрепиться за бойким или худощавым воином), либо крестьянами-однодворцами, получившими фамилию после отмены крепостного права.

Интересная деталь: в украинском языке слово «шкира» имеет ещё одно значение — «кора», «лучина», а также «оболочка». Поэтому не исключено, что прозвище дали человеку, занимавшемуся выделкой кож или сдиранием коры (для дубления или изготовления лыка). Однако первая версия — тощий или прижимистый человек — более распространена в ономастике.

С точки зрения словообразования Шкирынец стоит в одном ряду с фамилиями Бондарец, Ковалец, Швец — все они образованы от названий профессий или качеств, но с разными суффиксами. В отличие от массовых Шкирёвых или Шкириных, которые встречаются в России, форма на -ец привязана к западной диалектной зоне. Сегодня фамилия встречается редко, в основном в западных областях Украины и в Беларуси, а также среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке.