Фамилия Шкрабенко — характерный пример украинской модели фамилии с суффиксом -енко, который означает «маленький» или «сын» (буквально «сын Шкраба»). В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, где основа чаще всего — имя или профессия отца, украинские фамилии на -енко активно образовывали от прозвищ, и Шкрабенко не исключение.

Основа «шкраб» — это украинское диалектное слово, которое восходит к польскому «skrob» (скрести, скоблить). В юго-западных говорах (Волынь, Подолье, Галичина) «шкрабом» называли человека, который скребёт, то есть либо скрягу (скупого), либо того, кто занимался мелкой, кропотливой работой — например, скоблил доски, чистил что-то. Есть и вторая версия: в некоторых регионах «шкраб» — это прозвище писаря или учителя (от латинского «scriba» через польское посредство). Эта гипотеза менее распространена, но имеет право на существование: суффикс -енко часто присоединяли к именам людей, имевших отношение к грамоте (ср. Писаренко, Дьяченко).

Географически фамилия Шкрабенко тяготеет к центральной и западной Украине, особенно к Винницкой, Хмельницкой и Житомирской областям. В России она встречается редко и, как правило, занесена переселенцами. Интересно, что в белорусском языке есть однокоренные «шкраб» и «скроб» (скряга), что указывает на единый западнорусский ареал прозвища.

Таким образом, предок носителя фамилии Шкрабенко, скорее всего, был либо прижимистым хозяином, либо человеком, чья работа была связана с чисткой, скоблением (например, столяр или плотник). Менее вероятная, но возможная версия — сельский писарь, учитель. Выбор между этими значениями зависит от конкретной семейной истории, но лингвистически первое (от «скрести») выглядит надёжнее: оно зафиксировано в диалектных словарях и имеет параллели в фамилиях Скробот, Скробунов.