Фамилия Шныркина — женская форма фамилии Шныркин, а та, скорее всего, образована от прозвища Шнырка. В отличие от множества фамилий на -ов/-ев, которые часто связаны с отчествами от крестильных имён, эта опирается на прозвище, и корень её — «шныр-», который в русских говорах имел несколько значений.

Самое вероятное, что прозвище Шнырка дали человеку юркому, пронырливому, тому, кто «шныряет» — быстро и незаметно перемещается, всюду суёт нос. В словаре Даля глагол «шнырять» (или «шнырить») означает «рыскать, искать, шарить, соваться всюду». Прозвище могло быть ироничным или укоризненным, но не обязательно обидным — в крестьянской среде такие характеристики давали по поведению или привычкам.

Менее распространённая версия связывает основу с диалектным словом «шнырь» — так в некоторых областях называли водяного паука или мелкую рыбёшку, которая быстро снуёт у дна. В этом случае прозвище могло относиться к рыбаку или человеку, живущему у воды, но это скорее догадка, чем подтверждённый факт.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Шныркин — «сын Шнырки», «из семьи Шнырки». Такая модель типична для прозвищ, оканчивающихся на -а/-я, что характерно для северных и центральных русских говоров. Фамилия Шныркина не принадлежит к числу аристократических или дворянских — она из крестьянской или мещанской среды, где прозвища были повседневны.

Встречаемость фамилии невысокая, она редкая, что делает её интересной для локальной истории. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит искать их в документах по Владимирской, Костромской или Нижегородской губерниям — именно там фиксируются ранние упоминания подобных прозвищных фамилий.