Фамилия Шониева — редкий случай, когда географический и языковой ключ к разгадке лежит на поверхности, но требует уточнения. Её основа, скорее всего, восходит к осетинскому или ингушскому имени или прозвищу. В осетинском языке «Шони» может быть вариантом имени Сослан (через народную этимологию) или же производным от «шон» — «ночь», «темный». В ингушском языке существует мужское имя Шоани, которое в русской записи могло превратиться в Шони.

Суффикс «-ев» указывает на русскую модель образования фамилии от иноязычной основы. Это типично для народов Кавказа, чьи фамилии в XIX–XX веках записывались по русским паспортным стандартам. Форма Шониева (с ударением, предположительно, на втором слоге) — женский вариант, мужской будет Шониев. Такой суффикс добавлялся к основе, оканчивающейся на мягкий согласный или «и», что и произошло с именем Шони.

Есть и менее вероятная версия, связывающая фамилию с тюркским корнем «шон» — «честь», «слава». Но для тюркских языков характерны другие суффиксы (например, «-ов» после твердых согласных), поэтому кавказское происхождение выглядит убедительнее.

Носители фамилии Шониева встречаются в основном в Северной Осетии и Ингушетии, а также в среде выходцев из этих республик в других регионах России. Фамилия не относится к числу распространенных, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: предки, вероятно, жили в горной или предгорной местности и сохраняли родовое имя, которое при записи в метрические книги или советские документы русифицировалось.