Фамилия Шошена — редкий случай, когда перед нами не славянская, а тюркская модель образования, закрепившаяся в русском именослове. В основе лежит мужское имя Шошен, которое в тюркских языках восходит к слову со значением «радость», «веселье» или «праздник». В некоторых диалектах это имя могло быть формой арабского имени Шашин («сокол») или же местным прозвищем для жизнерадостного, шумного человека. Фамилия образована без патронимического суффикса — простым переносом имени в неизменном виде, что характерно для фамилий, возникших в среде крещёных татар, башкир или чувашей, а также для некоторых групп кавказских народов.

Формант -а на конце — это русское окончание, которое фамилия получила при адаптации в документах. В исходном виде, например, в татарской среде, она звучала бы как Шошен или Шөшен. Географически фамилия тяготеет к регионам Поволжья и Предуралья: в метрических книгах XIX века носители встречаются в Казанской, Уфимской и Оренбургской губерниях. Это указывает на то, что предки, скорее всего, были государственными крестьянами или мещанами из числа татар-мишарей или тептярей.

Сравнение с однокоренными фамилиями подсказывает ещё один поворот. В русском языке существует фамилия Шошин, которая происходит от имени Шоша — уменьшительной формы от Шошена. Здесь же мы видим полную форму исходного имени, что делает фамилию Шошена архаичной: она сохранила имя-основу без усечения, тогда как более поздние модели предпочитали сокращённый вариант. Встречается также вариант написания через «ё» — Шошёна, но в официальных записях преобладает именно Шошена.

Фамилия не получила широкого распространения и остаётся локальной. Среди дворянства и купечества первых гильдий она не зафиксирована — это фамилия крестьянского и мещанского сословия, что тоже говорит о её прозрачном, бытовом происхождении.