Фамилия Шпунюк звучит как типичная украинская фамилия, и это первая и главная зацепка. Формант -юк — один из самых распространённых западноукраинских суффиксов, особенно в Волынской, Ровенской, Хмельницкой и Тернопольской областях. Он указывает на родство или принадлежность: «чей?» — «Шпунюк» означает «сын Шпуня» или «человек из рода Шпуня». Это так называемый «патроним» по отцу или деду.

Сложность в основе — Шпун-. В украинском и русском языках слово «шпунт» знакомо плотникам и столярам: это продольный выступ на доске, входящий в паз. Однако прозвище «Шпунь» вряд ли дали бы за столярное мастерство — скорее за внешность или характер. «Шпунт» в переносном смысле могло означать «затычка», «коротышка», «невысокий плотный человек». В польском языке szpunt имеет то же значение, что усиливает версию о западноукраинском происхождении фамилии, где польское влияние было сильным.

Есть и более редкая, но правдоподобная версия. В некоторых говорах «шпунь» — это диалектное прозвище для человека с прищуром, щурящегося, как будто он всё время всматривается вдаль. Глагол «шпунять» мог означать «щуриться» или «смотреть исподлобья». Если это так, то фамилия образована от характерной манеры поведения или физической особенности.

Сравните с однокоренными фамилиями: Шпунтов, Шпунтенко, Шпунтиков. Все они восходят к тому же корню, но «Шпунюк» — самая «домашняя», деревенская форма, без книжного суффикса -ов. Сословно носители этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками (плотниками) из Западной Украины. Встречаемость фамилии невысокая, что говорит о локальном происхождении: родоначальник был известен в одном-двух сёлах, и прозвище закрепилось за его потомками.