Фамилия Шпырько образована по одной из самых распространённых в украинской ономастике моделей — с помощью суффикса -ко. Этот суффикс в украинских фамилиях часто выполнял уменьшительную или обиходную функцию, превращая прозвище или имя в фамилию. Основа фамилии — «шпырь» — слово, которое в южнорусских и украинских говорах имело несколько значений. Самое вероятное из них — «шип, колючка, острый предмет» (ср. «шпоры», «шпилька»). В переносном смысле «шпырь» — человек колкий, язвительный, любящий поддеть словом. В некоторых диалектах «шпырить» означало «колоть, тыкать», а в переносном — «дразнить, задирать». Таким образом, Шпырько — это, скорее всего, потомок человека, получившего прозвище Шпырь за острый язык или за характер.

Менее распространённая, но возможная версия связывает фамилию с ремеслом. «Шпырь» могло быть прозвищем мастера, работавшего с острыми инструментами — например, кузнеца, изготавливавшего шпоры, или сапожника, использовавшего шило. Однако в украинской среде прозвища, образованные от названий инструментов, чаще давались не по профессии, а по внешнему сходству или манере поведения.

Географически фамилия Шпырько тяготеет к центральным и восточным областям Украины, а также к югу России, куда переселялись украинские крестьяне в XVIII–XIX веках. Встречаются варианты написания — Шпирько, Шпырко, что связано с диалектным произношением. В отличие от фамилий на -ко, которые часто принадлежали казачеству или мещанству, Шпырько не имеет выраженной сословной окраски — такие фамилии бытовали в самых разных слоях населения.

С точки зрения словообразования, фамилия Шпырько сохранила редкую основу. В современных говорах слово «шпырь» почти вышло из употребления, и фамилия стала «тёмной» — её значение угадывается только через исторические словари и диалектные записи. Это делает её особенно интересной: носитель фамилии может считать себя хранителем почти забытого слова.