Фамилия Штукова — женская форма фамилии Штуков, и её происхождение связано с немецким или, реже, с русским диалектным словом. В основе лежит слово «штук» (от нем. Stück — «кусок», «штука», «предмет»). В русском языке это слово закрепилось в значении «отдельный предмет», «единица товара», а также в профессиональной лексике — например, у портных «штука» могла означать отрез ткани, у ремесленников — деталь изделия.

Первая и наиболее вероятная версия: Штуковыми называли потомков немцев-переселенцев, которые в XVIII–XIX веках массово приезжали в Россию. Фамилия могла возникнуть как прозвище человека, который занимался торговлей «штучным» товаром (например, сукном или железными изделиями, продававшимися поштучно). В немецкой среде фамилия Stuckow или Stückow встречается до сих пор, особенно в землях Бранденбург и Мекленбург-Передняя Померания.

Вторая версия, менее распространённая, но возможная: фамилия могла произойти от русского прозвища Штука — так в некоторых говорах называли хитрого, изворотливого человека («он ещё та штука»). В этом случае Штуков — типичная русская патронимическая фамилия с суффиксом -ов, отвечающая на вопрос «чей?»: сын Штуки.

Суффикс -ов в фамилии Штуков указывает на принадлежность к роду: Штуков — «сын Штука». Это одна из самых распространённых моделей русских фамилий, но в данном случае корень нерусского происхождения, что делает фамилию интересным примером культурного заимствования.

Встречается фамилия преимущественно в центральных и южных регионах России, а также в Поволжье, где исторически были колонии немецких поселенцев. В дворянских родословных книгах Штуковы не значатся — скорее всего, это фамилия мещан или крестьян, возможно, обрусевших немцев, которые перешли в православие и взяли фамилию по профессии или прозвищу.