Фамилия Шупаева — женская форма фамилии Шупаев, которая образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы прозвища или имени с помощью суффикса -ев. Этот суффикс присоединяли к основам на мягкий согласный или шипящий, указывая на принадлежность («чей сын?» — Шупаев). В основе лежит прозвище Шупай.

Прямое значение прозвища неочевидно, и здесь есть несколько версий. Самая правдоподобная связана с диалектным глаголом «шупать» — щупать, ощупывать. В русских говорах, особенно в южных и западных, «шупать» означало «трогать руками, искать вслепую». Прозвище Шупай могли дать человеку с характерной привычкой — например, тому, кто постоянно что-то ощупывал, проверял руками, или же слепому или подслеповатому, кто ориентировался на ощупь. В этом случае фамилия — из разряда «профессиональных» по поведению, а не по ремеслу.

Менее вероятна, но возможна связь с личным именем Шупай — производной формой от крестильного имени Иосиф (в бытовой речи Иосифов называли Осипами, а уменьшительные варианты могли давать и такие неожиданные формы). Однако эта версия слабее: имя Шупай не зафиксировано в святцах и не встречается в исторических документах как распространённое, в отличие от диалектной лексики.

Географически фамилия Шупаев (и Шупаева) тяготеет к регионам, где бытовал глагол «шупать»: это преимущественно южнорусские области — Курская, Орловская, Тамбовская, а также прилегающие территории Украины и Белоруссии. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении прозвища, не вышедшего за пределы одной диалектной зоны.

Обратите внимание на орфографию: фамилия пишется через «у», а не через «ю» (Шюпаева — ошибка). Встречающийся вариант Шупаев/Шупаева с ударением на второй слог (Шупáев) — норма, ударение на первый слог (Шýпаев) — региональная особенность, характерная для носителей из тех же южных говоров, где «шупать» произносили с ударным первым слогом.

Таким образом, предок современных Шупаевых, скорее всего, был человеком с характерной манерой поведения — или же получил прозвище от односельчан за привычку всё «шупать» руками. Фамилия недвусмысленно указывает на живую народную речь и бытовую наблюдательность, а не на книжное или церковное происхождение.