Фамилия Шурукина — женская форма, мужской вариант — Шурукин. Она относится к распространённому типу русских фамилий на -ин, которые образуются от основ, оканчивающихся на -а или -я. В данном случае основа — «Шурука».

Самая вероятная версия происхождения — от прозвища или имени Шурука. В русских говорах слово «шурукать» означало «шептать, шуршать, говорить тихо или сбивчиво». Прозвище Шурука могли дать человеку с тихим голосом, невнятной речью или, наоборот, любителю пошептаться и посплетничать. В некоторых диалектах «шурукать» значило также «искать, шарить, рыться» — в этом случае прозвище могло характеризовать непоседливого или дотошного человека.

Менее вероятна, но возможна связь с украинским или белорусским «шурувати» — «чистить, тереть». Тогда Шурукой могли прозвать того, кто занимался чисткой, например, трубочиста или уборщика. Однако для центральных и северных русских областей, где фамилия встречается чаще, основным остаётся диалектное «шурукать» в значении «шептать».

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Шурукин — сын Шуруки. Такие фамилии в XVI–XVII веках сначала закреплялись за крестьянами и посадскими людьми, а не только за дворянами. Фамилия Шурукина не принадлежит к числу аристократических, её носители, скорее всего, были выходцами из крестьянской или ремесленной среды.

Встречаются однокоренные фамилии Шуруков и Шурукин. Первая образована по той же модели, но от основы на твёрдый согласный (Шурук). Географически Шурукины рассеяны, но заметное число носителей фиксируется в Поволжье и на Урале — регионах, где сохранились архаичные диалектные слова.