Фамилия Шушева — женская форма фамилии Шушев. В её основе лежит прозвище Шуш, и здесь сразу возникает несколько версий. Самая прямая и правдоподобная: прозвище дали человеку, который шушукался, то есть шептался или тайно переговаривался. В русских говорах глагол «шушать» означал «шептать», «нашептывать», отсюда же «шушун» — тихий, скрытный человек. Фамилия образована по стандартной модели: к прозвищу на твердый согласный прибавили патронимический суффикс -ев (Шуш + ев). Вариант с суффиксом -ов здесь маловероятен: он бы дал форму Шушов, а Шушев указывает на основу, оканчивающуюся на шипящий или мягкий согласный.

Вторая версия отсылает к диалектному слову «шуша» — так в некоторых областях называли замарашку, неряху или, напротив, ленивого, вялого человека. В словаре Даля «шуша» упоминается как бранное прозвище неопрятного человека. В этом случае фамилия Шушев могла закрепиться за кем-то, кого в деревне дразнили за неряшливость. Третья, более редкая гипотеза — связь с тюркским корнем «шуш» (тихий, спокойный), но для русской фамилии это скорее случайное созвучие, которое не подтверждается географией бытования.

Географически фамилия Шушева встречается нечасто, но заметна в центральных и северных областях России — в Вологодской, Архангельской, Костромской губерниях. Там как раз были живы говоры, где «шушать» и «шуша» были в ходу. В документах XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских людей с прозвищем Шуш, от которого позже пошли Шушевы. Сословно фамилия, скорее всего, крестьянская или мещанская: в дворянских родословных она не зафиксирована.

Стоит отметить, что фамилия Шушев (и Шушева) может писаться с одной «ш» — Шусев, но это уже искажение, возникшее при переписи или из-за местного произношения. В любом случае, корень «шуш-» остаётся ключевым, и носитель фамилии может с равной вероятностью вести род от шептуна, тихони или неопрятного человека.