Фамилия Шваркина — женская форма фамилии Шваркин. Её основа — слово «шварка», которое имеет несколько значений, и происхождение фамилии напрямую зависит от того, в каком регионе и в какой среде она возникла.

Самый вероятный источник — диалектный глагол «шваркать», то есть бить, хлестать, шлёпать, а также бросать, кидать с шумом. В таком случае «шварка» — прозвище человека шумного, резкого в движениях, возможно, драчуна или того, кто работает с грохотом (например, кузнеца или плотника). Модель образования проста: прозвище Шварка + типичный русский суффикс принадлежности -ин, указывающий на родство: «чей?» — «Шваркин», то есть сын или потомок Шварки.

Менее распространённая, но не исключённая версия — связь с украинским или южнорусским словом «шварка» в значении «шкурка», «кожица» (сравните: «шваркать» — сдирать кожу, обдирать). В этом случае прозвище мог получить кожевник, скорняк или просто бережливый человек, собирающий обрезки. Третья, совсем редкая гипотеза — происхождение от немецкого Schwarz (чёрный) через польское или еврейское посредничество, но тогда фамилия скорее имела бы форму Шварц или Шварцев. Форма Шваркин, с русским суффиксом, указывает на адаптацию на русской почве, но в таком случае ожидаемо было бы ударение на первом слоге (Швáркин), тогда как в русской традиции фамилия чаще произносится с ударением на втором (Шваркúн).

Фамилия не относится к числу аристократических или дворянских. Скорее всего, её носители — потомки крестьян или ремесленников из центральных и южных губерний России, где был распространён этот глагол. Географически фамилия встречается рассеянно, без ярко выраженного гнезда, что говорит о её прозвищном, а не топонимическом происхождении.