Фамилия Шварцун — редкий случай на стыке немецкого корня и славянской модели словообразования. Основа «шварц-» восходит к немецкому «schwarz» — «чёрный». В немецкой среде это либо прозвище по цвету волос или кожи, либо указание на человека, занимавшегося чёрной работой, либо, реже, топонимическая отсылка (например, к городу Шварц в Тюрингии). Но сам формант «-ун» — не немецкий, а восточнославянский. В украинском, белорусском и южнорусском говорах суффикс «-ун» образует прозвища по действию или признаку: «говорун», «крикун», «чернун». Фамилия Шварцун, скорее всего, возникла на территории современной Украины или Беларуси, где немецкие колонисты или переселенцы получали прозвища, адаптированные местным населением. То есть носитель фамилии — потомок человека, которого окружающие называли «чёрным» по-немецки, но оформили это по-славянски.

Вторая версия, менее правдоподобная, — что фамилия чисто немецкая, но с суффиксом «-un», который встречается в немецких фамилиях (например, «Schwarzun»). Однако в немецкой ономастике такой суффикс нехарактерен и встречается крайне редко, обычно как вариант написания или диалектная форма. Поэтому славянская адаптация выглядит убедительнее.

Примечательна и словообразовательная модель: в отличие от типичных русских фамилий на «-ов» или «-ин», Шварцун сохранила исходное прозвище почти без изменений. Это указывает на позднее оформление фамилии (XVII–XIX века), когда фиксация прозвищ шла уже без добавления патронимических суффиксов. Географически фамилия встречается в основном на западе России, в Беларуси и на Украине, а также среди потомков эмигрантов. В дореволюционных источниках она не фиксируется как дворянская или купеческая — скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где немецкое влияние смешалось с местными языковыми привычками.