Фамилия Сиитов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. На первый взгляд она похожа на множество фамилий на -ов, образованных от имени или прозвища, но её основа «Сиит» ставит в тупик. В русском языке нет распространённого слова или имени с таким корнем, поэтому разгадка лежит либо в иноязычном заимствовании, либо в искажении исходной формы.

Самая вероятная версия — фамилия Сиитов восходит к тюркскому или кавказскому имени Сиит (варианты: Сеит, Сейит). В этих языках «сеит» или «сейид» означает «господин», «потомок пророка» (почётный титул у мусульман). Попадая в русскую среду, такое имя могло адаптироваться через суффикс -ов, образовав фамилию по стандартной модели: «чей?» — Сиитов, то есть «сын или потомок Сиита». Следы этой фамилии встречаются в Поволжье, на Урале и в Сибири, где исторически были сильны тюркские влияния.

Менее вероятная, но возможная гипотеза — связь с русским диалектным словом «сиит» или «сиеть». В некоторых говорах «сиеть» означало «сиять», «блестеть», а «сиит» могло быть прозвищем блестящего, видного человека. Однако эта версия слабее: ни в одном серьёзном ономастическом словаре (например, у Б. Унбегауна или В. Никонова) такой основы для фамилий не зафиксировано. Скорее всего, перед нами пример, когда редкое восточное имя прижилось в русской среде и дало начало немногочисленному, но устойчивому роду.

Примечательно, что фамилия Сиитов не имеет типичных русских суффиксов вроде -их или -ский, что дополнительно указывает на её «пришлый» характер. Носители этой фамилии, скорее всего, потомки людей, получивших прозвище или имя от тюркского «сеит», и их предки могли быть либо выходцами из татарских или башкирских родов, либо служилыми людьми, принявшими православие и сохранившими родовое имя в адаптированной форме.