Фамилия Синтюрин образована от прозвища Синтюра. В его основе, скорее всего, лежит диалектное слово «синтювка» — так в некоторых говорах называют уклейку, небольшую рыбу из семейства карповых. Уклейка — рыбка шустрая и юркая, обитает в реках, озёрах и водохранилищах, встречается даже в солоноватой воде устьев рек. Прозвище Синтюра могли дать рыбаку, который промышлял ловлей уклейки, либо человеку, который внешне или по характеру напоминал эту рыбу — например, был невысоким, подвижным или вертлявым.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русских фамилий: к основе Синтюр- добавили суффикс -ин, который указывает на принадлежность потомку человека с этим прозвищем. То есть Синтюрин буквально значит «сын Синтюры», «ребёнок Синтюры». Такая модель широко распространена в центральной России и Поволжье, где фамилии на -ин часто образовывались от прозвищ и имён, оканчивающихся на гласный или мягкий согласный.

Есть и другая, менее вероятная версия. Согласно ей, Синтюра — это уменьшительная форма имени Авксентий, которое в переводе с греческого означает «возрастающий, увеличивающийся». Однако эта гипотеза выглядит сомнительной: переход от полного церковного имени Авксентий к форме Синтюра фонетически трудно объяснить, и в ономастической литературе такие трансформации не зафиксированы. Поэтому версия с прозвищем от названия рыбы остаётся основной.

Сама фамилия Синтюрин довольно редкая, она не входит в число массовых русских фамилий. Встречается преимущественно в регионах, где были распространены диалектные названия рыб, — вероятно, в среднем течении Волги или на юге России. Как и многие фамилии, образованные от прозвищ, она не указывает на сословие: прозвище Синтюра мог получить и крестьянин, и посадский человек, и даже служилый. Следов дворянского рода с такой фамилией в исторических документах не обнаруживается, что тоже говорит в пользу её «народного» происхождения.

Потомки человека по прозвищу Синтюра со временем унаследовали фамилию Синтюрин. Сегодня она сохраняется как память о прозвище, которое когда-то метко подмечало либо занятие предка, либо его характер.