Фамилия Синюшко — хороший пример того, как прозвище, данное по внешности, закрепилось в родовом имени. В её основе лежит прилагательное «синий» в уменьшительно-ласкательной или уничижительной форме «синюшка». Так на Руси могли назвать человека с синюшным оттенком кожи, например, от постоянного холода или болезни, либо того, кто часто носил одежду синего цвета. Суффикс -к- здесь не столько фамильный, сколько уменьшительный, что характерно для прозвищ, а не для окончаний готовых фамилий.

Словообразовательная модель Синюшко указывает на украинское или белорусское происхождение. В этих языках фамилии на -ко, -енко, -ук массово образовывались от прозвищ и имён. Суффикс -ошк- (Син-юшк-о) встречается реже, чем просто -к-, и придаёт прозвищу оттенок ласкательности или, наоборот, пренебрежения. Фамилии типа Синюшко, Белошко, Чернушко строились по одной схеме: корень цвета + суффикс -ушк-/-юшк- + окончание -о.

Географически фамилия привязана к западнорусским землям, особенно к современной Украине и Белоруссии. В дореволюционных переписях Синюшко встречается в Черниговской, Полтавской, Могилёвской губерниях. Это говорит о том, что носители фамилии были преимущественно крестьянами или казаками — дворянские роды с такой основой не фиксируются.

Есть и менее вероятная, но допустимая версия: связь с диалектным словом «синюшка» — так в некоторых говорах называли синицу или растение с синими цветами (василёк, синюху). В этом случае прозвище могло отражать характер человека — бойкий, как синица, или любовь к определённому цвету в хозяйстве. Однако внешний признак — самая прямая и частая причина появления таких фамилий.

В написании фамилия устойчива: ударение падает на второй слог — Синю́шко. Вариант Синюшко́ (с ударением на -о) встречается реже и характерен для южных говоров. Фамилия не склоняется по падежам в мужском роде, что типично для украинских фамилий на -о.